Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snapc4Q8BP86 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snapc4Q8BP86 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snapc4Q8BP86 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms