Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga3Q8BMI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gga3Q8BMI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms