Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c2Q8BL74 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf3c2Q8BL74 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c2Q8BL74 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms