Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop53Q8BK35 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop53Q8BK35 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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