Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp1Q8BJQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp1Q8BJQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms