Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy1Q8BIJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy1Q8BIJ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy1Q8BIJ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms