Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra5Q8BHJ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms