Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmco3Q8BH01 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmco3Q8BH01 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco3Q8BH01 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms