Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2af1l4Q8BGJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms