Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Htatsf1Q8BGC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Htatsf1Q8BGC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Htatsf1Q8BGC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.3 ms