Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pknox2Q8BG99 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox2Q8BG99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox2Q8BG99 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms