Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdspl2Q8BG15 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdspl2Q8BG15 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms