Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc17a8Q8BFU8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc17a8Q8BFU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc17a8Q8BFU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms