Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y55

Bsdc1, BSD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bsdc1Q80Y55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bsdc1Q80Y55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bsdc1Q80Y55 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bsdc1Q80Y55 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bsdc1Q80Y55 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bsdc1Q80Y55 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms