Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan18Q80WR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan18Q80WR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan18Q80WR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan18Q80WR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan18Q80WR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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Tspan18Q80WR1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan18Q80WR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan18Q80WR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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