Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdrkhQ80VL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdrkhQ80VL1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdrkhQ80VL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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