Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RubcnQ80U62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RubcnQ80U62 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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RubcnQ80U62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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RubcnQ80U62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RubcnQ80U62 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RubcnQ80U62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms