Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC47.1■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC47.07■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
NischQ80TM9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
NischQ80TM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
NischQ80TM9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
NischQ80TM9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC46.81■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC46.78■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC46.76■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
NischQ80TM9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
NischQ80TM9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
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