Protein–RNA interactions for Protein: Q80TF4

Klhl13, Kelch-like protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl13Q80TF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Klhl13Q80TF4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl13Q80TF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl13Q80TF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms