Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms