Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms