Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpf1Q7TND5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf1Q7TND5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.3 ms