Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sys1Q78S06 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170 ms