Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Eci3Q78JN3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eci3Q78JN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms