Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rhox8Q6VSS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rhox8Q6VSS7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rhox8Q6VSS7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Rhox8Q6VSS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Rhox8Q6VSS7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Rhox8Q6VSS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms