Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scgb2b2Q6UGQ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scgb2b2Q6UGQ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms