Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gja6Q6S5G4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja6Q6S5G4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms