Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf3Q6QR59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf3Q6QR59 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf3Q6QR59 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms