Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr12Q6QNU9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr12Q6QNU9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr12Q6QNU9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr12Q6QNU9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tlr12Q6QNU9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr12Q6QNU9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms