Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms