Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclk2Q6PGN3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dclk2Q6PGN3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk2Q6PGN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk2Q6PGN3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk2Q6PGN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms