Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rasa4Q6PFQ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasa4Q6PFQ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasa4Q6PFQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasa4Q6PFQ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms