Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc36Q6PDM4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc36Q6PDM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms