Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cachd1Q6PDJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cachd1Q6PDJ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cachd1Q6PDJ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cachd1Q6PDJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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