Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad17Q6NXW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad17Q6NXW6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rad17Q6NXW6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad17Q6NXW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms