Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp140Q6NSQ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms