Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mvb12bQ6KAU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mvb12bQ6KAU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mvb12bQ6KAU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms