Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ParpbpQ6IRT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ParpbpQ6IRT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms