Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt40Q6IFX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt40Q6IFX3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms