Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hecw2Q6I6G8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hecw2Q6I6G8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hecw2Q6I6G8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw2Q6I6G8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Hecw2Q6I6G8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Hecw2Q6I6G8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw2Q6I6G8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw2Q6I6G8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw2Q6I6G8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw2Q6I6G8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms