Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lemd2Q6DVA0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lemd2Q6DVA0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lemd2Q6DVA0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lemd2Q6DVA0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lemd2Q6DVA0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lemd2Q6DVA0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms