Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf8Q6DID3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Scaf8Q6DID3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf8Q6DID3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms