Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msl2Q69ZF8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msl2Q69ZF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msl2Q69ZF8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms