Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mysm1Q69Z66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mysm1Q69Z66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mysm1Q69Z66 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms