Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CltcQ68FD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CltcQ68FD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CltcQ68FD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CltcQ68FD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CltcQ68FD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CltcQ68FD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CltcQ68FD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CltcQ68FD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CltcQ68FD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CltcQ68FD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms