Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VclQ64727 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VclQ64727 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VclQ64727 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VclQ64727 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VclQ64727 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VclQ64727 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VclQ64727 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VclQ64727 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VclQ64727 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VclQ64727 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VclQ64727 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VclQ64727 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VclQ64727 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VclQ64727 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VclQ64727 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VclQ64727 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VclQ64727 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VclQ64727 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VclQ64727 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VclQ64727 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VclQ64727 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VclQ64727 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VclQ64727 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VclQ64727 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VclQ64727 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VclQ64727 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VclQ64727 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VclQ64727 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VclQ64727 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VclQ64727 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VclQ64727 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VclQ64727 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VclQ64727 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VclQ64727 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VclQ64727 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VclQ64727 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VclQ64727 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VclQ64727 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VclQ64727 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VclQ64727 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VclQ64727 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VclQ64727 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VclQ64727 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VclQ64727 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VclQ64727 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VclQ64727 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VclQ64727 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VclQ64727 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VclQ64727 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms