Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e1Q64104 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr2e1Q64104 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e1Q64104 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms