Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a5Q63ZW6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a5Q63ZW6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a5Q63ZW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms