Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga3Q62470 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga3Q62470 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga3Q62470 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms