Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vat1Q62465 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vat1Q62465 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vat1Q62465 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vat1Q62465 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vat1Q62465 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vat1Q62465 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vat1Q62465 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vat1Q62465 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vat1Q62465 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vat1Q62465 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vat1Q62465 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vat1Q62465 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vat1Q62465 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vat1Q62465 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vat1Q62465 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vat1Q62465 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms